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新技術能夠準確指征腸道微生物的起源

作者:佚名 來源:生物谷 日期:2019-06-13
導讀

         加州大學洛杉磯分校領導的研究團隊已經開發出一種更快,更準確的方法來確定人體中許多細菌的來源。從廣義上講,該工具可以推斷出任何微生物組的起源。

關鍵字:  腸道微生物 

        與需要數天或數周的工具相比,新的計算工具“FEAST”可以在短短幾個小時內分析大量遺傳信息。該軟件程序可用于醫療保健,公共衛生,環境研究和農業。該研究在線發表在《Nature Methods》上。

        微生物組通常包含數百至數千種微生物物種。人類的消化道、湖泊和河流,到處都可以找到微生物的存在。了解這些生物來自何處以及這些群落如何形成可以讓科學家更詳細地了解影響人類健康的微觀生態過程。對此,研究人員開發了新型程序,為醫生和科學家提供了一種更有效的工具來研究微生物的組成。

        有了這些信息,醫生將能夠通過簡單地分析他們的微生物組來區分健康人和患有特定疾病的人。科學家可以使用該工具檢測水資源或食品供應鏈中的污染。

        “微生物組已經與人體生理學和健康的許多方面聯系在一起,但我們正處于了解微生物組的臨床意義的早期階段,”作者說道:“微生物組數據得到了前所未有的擴展,這使我們對微生物生命的各種功能和分布的了解迅速增加,盡管如此,如此龐大而復雜的數據集卻帶來了統計和計算方面的難題。”

        研究人員表示,與其他源跟蹤工具相比,FEAST的速度提高了300倍,并且更準確。此外,目前的工具只能分析較小的數據集,或僅針對被認為是有害污染物的特定微生物。研究人員說,這種新工具可以處理更大的數據集,并提供更完整的微生物信息以及來源。

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